愤怒之下，万磁王疯狂报复军方。
招架不住兄弟会无孔不入的攻势的军方终于意识到问题。
而另一边，双方不分昼夜的对抗已经严重影响到了国普通国民的日常生活和安全，怀特宫和神盾局强势介入，要求双方停战。
在神盾局的监督下，军方、x学院、神盾局达成了三方协议，宣布恩仇既往不咎，从此刻开始休战。
军方不得再伤害变种人，变种人阵营也不得再攻击军方。
但军方却假造了有关于石茧和实验基地的情报。
从那时起，这个基地如石沉大海，彻底消失在众人的视野内。
——除了从一开始就派驻了卧底的九头蛇。
“神盾局也早就失去了对这个实验基地的情报掌控。直到我们以为是平常的解救变种人任务拿到012基地的情报，却意外发现了嬴政的存在。确认了它其实就是当年的绝密a012基地，而嬴政，就是九年前石茧中的生命体。”
娜塔莎说起此刻被x教授拿在手里的试剂管的来龙去脉时，怒意让她几乎咬碎了牙：“嬴政烧毁了整个实验基地，实验人员和文件也都没有留下。当时我们虽然猜到了实验基地在做的事情，却只以为那场大火烧干净了一切，九头蛇的这份罪孽也就到此为止了。”
“但是我和嬴政都没有想到，会在纽约城里找到另一个在继续进行这项实验的基地。甚至从对那些实验人员的审问来看，九头蛇还不死心，想要绑架嬴政，继续进行变种人控制方法的课题——直到现在，九头蛇依旧认为，对嬴政的研究能让他们获得强大的力量和控制变种人的方法。”
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